Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX1P78337 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITX1P78337 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITX1P78337 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX1P78337 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms