Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms