Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms