Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLMP54132 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLMP54132 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLMP54132 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLMP54132 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLMP54132 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLMP54132 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLMP54132 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms