Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMSP52788 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMSP52788 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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