Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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