Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms