Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms