Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5OP48047 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP5OP48047 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5OP48047 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5OP48047 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms