Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIA2P42262 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms