Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC26A3P40879 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms