Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP8P40818 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP8P40818 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP8P40818 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms