Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms