Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms