Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA5P31644 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA5P31644 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms