Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms