Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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