Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HTR2CP28335 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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