Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms