Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms