Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms