Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDSP20132 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SDSP20132 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SDSP20132 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SDSP20132 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SDSP20132 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SDSP20132 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDSP20132 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDSP20132 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms