Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms