Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL2P13500 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL2P13500 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL2P13500 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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