Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms