Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms