Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms