Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms