Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APODP05090 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APODP05090 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APODP05090 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APODP05090 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms