Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms