Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C6orf47O95873 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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