Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMUO75648 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms