Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms