Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL13O43927 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL13O43927 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms