Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCO2O43819 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCO2O43819 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms