Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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