Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms