Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP290O15078 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP290O15078 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP290O15078 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP290O15078 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP290O15078 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP290O15078 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP290O15078 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP290O15078 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP290O15078 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP290O15078 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms