Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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