Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms