Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms