Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms