Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms