Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms