Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms