Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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