Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2AQ9UQM7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms