Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms