Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms