Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms